Osnovne metode u molekularnoj biologiji i medicini (1115)

naslovna izv.prof.dr. sc. Andreja Ambriović Ristov, zn. savjetnica
naslovna izv. prof.dr. sc. Neda Slade, zn. savjetnica

Institut Ruđer Bošković

naslovna doc.dr.sc. Dragomira Majhen, viša zn. suradnica
naslovna doc.dr.sc. Anđela Horvat, zn. suradnica
naslovna doc.dr.sc. Ignacija Vlašić, zn. suradnica

Usvojiti teoretska i praktična znanja o osnovnim metodama rada u biologiji i medicini.

Predmet je skup predavanja i vježbi kojima su obuhvaćene najvažnije metode u eksperimentalnom radu u biologiji i medicini. Većina metoda uključuje i vježbe koje se izvode u laboratoriju. Svaki predavač u okviru predmeta počinje sa teoretskim uvodom, kako bi studenti mogli dalje pratiti praktični rad. Predviđa se kontinuirano obogaćivanje sadržaja predmeta modernim metodama. Na seminarima se zajednički obrađuju članci samih predavača s ciljem da se objasni zašto se i za koju svrhu određena metoda upotrebljava.
Predmet uključuje praktičan rad, međutim neke metode zbog dužine trajanja i/ili cijene, obrađuju se samo pokazno. Predviđa se kontinuirano obogaćivanje sadržaja predmeta modernim metodama. Na seminarima se zajednički obrađuju članci samih predavača s ciljem da se objasni zašto se i za koju svrhu određena metoda upotrebljava.
Predmet obuhvaća sljedeće metode: izolacija DNA i RNA, elektroforeza u agaroznom gelu, lančana reakcija polimerazom (PCR), reverzna transkripcija (RT), natrij dodecil sulfat elektroforeza (SDS-PAGE), Western blot, analiza produkata reakcije PCR cijepanjem uz pomoć restrikcijskih enzima (RFLP), imunocitokemija, kulture stanica, transfekcija, određivanje apoptoze (fluorescencijom, izolacijom DNA fragmenata), kloniranje u plazmidni vektor, Southern i dot blot hibridizacija, real time PCR, određivanje primarnog slijeda nukleotida-sekvenciranje, heteroduplex analiza, analiza gubitka heterozigotičnosti, analiza jednolančanih oblika DNA, biblioteke gena, konfokalna laserska pretražna mikroskopija, elektronska mikroskopija, Ames test, gel elektroforeza u promjenjivom električnom polju (PFGE), biokemijske metode pročišćavanja proteina, DNA microarray.

1. Objasniti principe osnovnih metoda molekularne biologije.
2. Kritički prosuditi relevantnost korištenih materijala i metoda u člancima iz područja molekularne biologije s obzirom na postavljen istraživački zadatak/cilj.
3. Samostalno planirati i napisati poglavlje Materijali i metode u znanstvenom članku i doktorskoj disertaciji.

Redovito pohađanje predavanja i aktivno sudjelovanje na seminarima i vježbama.

U početku će se vježbe izvoditi u laboratorijima predavača, ali s vremenom se nadamo da će Institut Ruđer Bošković osigurati jedan manji laboratorij namijenjen upravo toj svrsi. Ovaj predmet temelji se na trogodišnjem iskustvu obrazovnog projekta "METODOLOŠKI TEČAJEVI U BIOLOGIJI I MEDICINI" koji se organiziraju u sklopu Instituta Ruđer Bošković www.metode.avalon.hr

Metode u molekularnoj biologiji, Ambriović Ristov A., Brozović A., Bruvo Mađarić B., Ćetković H., Herak Bosnar M., Hranilović D., Katušić Hećimović S., Meštrović Radan N., Mihaljević S., Slade N.,Vujaklija D. (urednice). Institut Ruđer Bošković, Zagreb, 2007.

Odabir najnovijih članaka iz literature; mijenja se svake godine.

Uspješnost kolegija će evaluirati svake godine zajedničko stručno povjerenstvo Instituta Ruđer Bošković, Sveučilišta u Dubrovniku i Sveučilišta u Osijeku, a voditelji će putem ankete od polaznika dobiti informacije o primjerenosti programa i uspješnosti od strane voditeljstva.